Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 9

Zgodnie z oczekiwaniami pierwotne zwłóknienie mielin było związane z krótszym czasem przeżycia w porównaniu z nadpłytkowością samoistną (współczynnik ryzyka zgonu, 7,1; 95% przedział ufności [CI], 4,9 do 10,2; P <0,001). Ponadto rodzaj zmutowanego genu miał niezależny wpływ na przeżycie. W porównaniu z chorymi z mutacją CALR pacjenci z mutacją JAK2 mieli wyższe ryzyko zgonu (współczynnik ryzyka, 3,1; 95% CI, 2,0 do 4,7; p <0,001), podobnie jak u osób z mutacją MPL (współczynnik ryzyka, 3,5; 95% CI, 1,8 do 6,7; P <0,001). Skumulowana częstość występowania zakrzepicy w nadpłytce zasadniczej została obliczona przy zastosowaniu podejścia konkurencyjnego ryzyka, 24 ze śmiercią z dowolnej przyczyny jako zdarzenie konkurencyjne; krzywe są pokazane na rysunku 4C, a dane są przedstawione w tabeli S8 w dodatkowym dodatku. Read more „Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 9”

Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 8

Zakładając, że status mutacji nie zmieniał się z czasem, przeprowadziliśmy analizy przeżycia z datą wstępnej diagnozy jako początkiem obserwacji. Ponieważ 6 pacjentów zostało wykluczonych z powodu niewystarczającej obserwacji, zbadano łącznie 1102 pacjentów. Mediana okresu obserwacji dla całej grupy pacjentów z dowolnym z trzech zmutowanych genów wynosiła 5,7 lat (zakres od 0 do 31). Rycina 4. Read more „Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 8”

Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 7

Dwie mutacje były na tym samym allelu. Zmutowane CALR znaleziono we wczesnym klonie u obu pacjentów; role innych zmutowanych genów są niejasne. Wykresy po prawej stronie przedstawiają schematycznie historię klonalną, która dała początek klonalnej kompozycji obserwowanej w czasie próby. Różne kolory wskazują różne klony, jak pokazano na wykresach słupkowych. Read more „Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 7”

Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 6

C-końcowy motyw KDEL jest tracony we wszystkich wariantach mutacji (tabela S6 w dodatkowym dodatku). W zależności od rodzaju mutacji zmutowane białka zachowują różne ilości ujemnie naładowanych aminokwasów nie zmutowanej kalretikuliny. Delecje o długości 52 pz (typ 1) eliminują prawie wszystkie ujemnie naładowane aminokwasy, podczas gdy insercje o 5 pz (typ 2) zachowują około połowę aminokwasów naładowanych ujemnie (Figura 2C). Ryc. Read more „Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 6”

Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 5

Chociaż większość z tych pacjentów miała niezmutowany ekson CALR 9, w sumie 3 pacjentów z RARS-T miało mutacje w CALR (Figura 1B), wszystkie z niezmutowanymi JAK2 i MPL (Figura 1C). Mutacje w genie kodującym czynnik splicingowy 3B, podjednostka (SF3B1) współwystępowały z mutacjami we wszystkich trzech genach. Spośród 524 zdrowych uczestników badania miał 3-bp usuwaną w ramce w CALR. Mutacje CALR i nowy peptyd C-końcowy w Mutant CALR
Figura 2. Read more „Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 5”

Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 3

Produkty PCR oczyszczono i przeprowadzono reakcję sekwencjonowania za pomocą BigDye Terminator, wersja 3.1, Cycle Sequencing Kit (Life Technologies). Produkty sekwencjonowania analizowano przy użyciu 3130xl Genetic Analyzer (Applied Biosystems). Aby zbadać mutacje insercji i delecji w eksonie CALR, zaprojektowaliśmy startery PCR obejmujące ekson 9 i znakowano starter przedni 6-karboksyfluoresceiną. Po PCR produkty były sortowane na analizatorze genetycznym 3130xl. Read more „Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 3”

Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 2

Podczas gdy somatyczne mutacje JAK2 występują u niemal wszystkich pacjentów z czerwienicą prawdziwą, 9 około jedna trzecia pacjentów z niezbędną nadpłytkowością lub pierwotną mielofibrozą nie wykazuje żadnej mutacji w JAK2 lub MPL.7,8 Mutacje somatyczne w innych genach, takie jak TET2, 10,11 CBL, 12,13 EZH2, 14,15 DNMT3A, 16 i ASXL1, 17 są obecne w proporcji przypadków nowotworów mieloproliferacyjnych, ale mogą one współwystępować z mutacjami JAK2 i MPL i znajdują się w wszystkie rodzaje nowotworów szpikowych. Naturalna historia nowotworów mieloproliferacyjnych z chromosomem Philadelphia nie charakteryzuje się występowaniem powikłań zakrzepowo-zatorowych, ale także tendencją do progresji do bardziej agresywnej choroby, w tym mielofibrozy po policytemii vera lub nadpłytkowościowej zwłóknienia mielobakterii i ostrej białaczki szpikowej lub zapalenia Choroba stopnia 1. Postęp choroby związany jest zazwyczaj z nabywaniem mutacji somatycznych w genach kierujących odpowiedzialnych za ewolucję subklonalną.18-22 Jednak te zmutowane geny nie odgrywają głównej roli w patogenezie nadpłytkowości podstawowej lub pierwotnej zwłóknienia szpikowego z niezmutowanymi JAK2 i MPL. Przeprowadziliśmy sekwencjonowanie całego eksonu, aby zidentyfikować mutacje somatyczne odpowiedzialne za inicjację choroby w tych podgrupach nowotworów mieloproliferacyjnych. Read more „Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 2”

Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych

Około 50 do 60% pacjentów z niezbędną nadpłytkowością lub pierwotną mielofibrozą ma mutację w genie kinazy Janus 2 (JAK2), a dodatkowe 5 do 10% ma mutacje aktywujące w genie receptora trombopoetyny (MPL). Jak dotąd nie zidentyfikowano żadnego swoistego markera molekularnego u pozostałych 30 do 45% pacjentów. Metody
Przeprowadziliśmy sekwencjonowanie całego egzema w celu identyfikacji nabytych somatycznie mutacji u sześciu pacjentów, którzy mieli pierwotną mielofibrosę bez mutacji w JAK2 lub MPL. Następnie przeprowadzono sekwencjonowanie CALR, kodującego kalretikulinę w kohortach pacjentów z nowotworami szpikowymi. Read more „Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych”

Ocena schematów antyretrowirusowych drugiej linii w terapii HIV w Afryce AD 10

Tendencja do umiarkowanej przewagi raltegrawiru w odniesieniu do zwiększenia liczby CD4 +, bez różnic w supresji wiremii, może odzwierciedlać niezależne działanie raltegrawiru na aktywację lub przeżycie komórek T, 24,25, ale nie było żadnej korzyści klinicznej w 96. tygodniu. Obserwacja do 144 tygodnia oceni wyniki długoterminowe i opłacalność, dane, które są niezbędne do oceny nowego schematu przed wdrożeniem na dużą skalę. Nie wykazaliśmy nie gorszej jakości monoterapii inhibitorem proteazy w terapii skojarzonej z NRTI w odniesieniu do pierwotnego punktu końcowego, a monoterapia powodowała gorszą supresję wirusa, co było związane ze zwiększoną opornością na inhibitor proteazy. Read more „Ocena schematów antyretrowirusowych drugiej linii w terapii HIV w Afryce AD 10”