Mutacje somatyczne kalretikuliny w nowotworach mieloproliferacyjnych AD 6

C-końcowy motyw KDEL jest tracony we wszystkich wariantach mutacji (tabela S6 w dodatkowym dodatku). W zależności od rodzaju mutacji zmutowane białka zachowują różne ilości ujemnie naładowanych aminokwasów nie zmutowanej kalretikuliny. Delecje o długości 52 pz (typ 1) eliminują prawie wszystkie ujemnie naładowane aminokwasy, podczas gdy insercje o 5 pz (typ 2) zachowują około połowę aminokwasów naładowanych ujemnie (Figura 2C). Ryc. 3. Ryc. 3. Powiązanie mutacji CALR z dysfunkcjami nieparzystymi i hierarchicznymi hierarchiami u pacjentów z wieloma mutacjami somatycznymi. Panel A pokazuje wyniki analizy wielkości produktu reakcji łańcuchowej polimerazy / łańcucha reakcji eksonu 9 CALR u trzech pacjentów z insercją o 5 pz. U tych trzech pacjentów zmutowany pik allelu jest wyższy niż niezmutowany pik allelu, co wskazuje na obecność komórek homozygotycznych pod względem mutacji. Wykresy po prawej stronie przedstawiają dane z macierzy polimorfizmów ludzkiego pojedynczego nukleotydu (SNP) w genomie, wersja 6.0 (Affymetrix). Każda kropka reprezentuje pojedynczy SNP. Oś x pokazuje pozycję genomu, a oś y status alleliczny SNP (alleliczna różnica 0 wskazuje status heterozygotyczny) zgodnie z intensywnością fluorescencji. Dane z tablicy pokazują, że trzy próbki mają klony z jedno-macierzową disomią chromosomu 19p o różnych rozmiarach, co odpowiada różnicom w wysokościach pików obserwowanych w analizie fragmentów CALR. Podsumowując, wyniki wskazują, że homozygotyczność zmutowanego CALR pochodzi z duplikacji mutacji heterozygotycznej w wyniku nabycia disomii jednozasadowej u trzech pacjentów. Niebieskie kwadraty wskazują region genomiczny zaburzeń jednoosobowych. Panel B pokazuje hierarchie klonalne pochodzące z analizy hematopoetycznych kolonii progenitorowych. Pacjent H_0191 miał mutacje somatyczne w czterech genach. Jak pokazano na wykresie słupkowym, 51% kolonii miało mutacje w CALR, GAB2 i METTL11B. Inne kolonie (48%) posiadały mutacje we wszystkich czterech genach, co wskazuje, że mutacja w genie kodującym białko 16 palców homeo domeny homeo domeny (PHF16) została nabyta później i dała początek subklonowi. Ponadto jedna kolonia (1%) miała delecję 1-bp w CALR, w przeciwieństwie do delecji 52-bp obserwowanej w próbce granulocytów i we wszystkich innych koloniach od tego pacjenta. Ponieważ ta kolonia nie miała żadnej innej mutacji obserwowanej u pacjenta, reprezentuje niezależny klon, chociaż ten wniosek opiera się tylko na pojedynczej kolonii. Pacjent H_0296 miał mutacje somatyczne w CALR, PIK3R i C10orf71. Wszystkie kolonie analizowane od tego pacjenta miały wszystkie trzy mutacje. Jedna kolonia wykazała delecję 18 pz w CALR, oprócz delecji 1-bp obserwowanej u tego pacjenta
[patrz też: wysiłkowe nietrzymanie moczu, endometrioza przyczyny, hostessy fordanserki ]

Powiązane tematy z artykułem: endometrioza przyczyny hostessy fordanserki wysiłkowe nietrzymanie moczu